1、采用符合要求的材料建造潔凈室
潔凈室的污染控制是一項系統工程，需多種措施有效配合，才能以小的代價來達到有效的污染控制。潔凈室的墻壁、地面、頂棚應不產塵、少積塵、不易孳生細菌、無接縫或少接縫且接縫應嚴密。符合要求的材料有彩鋼夾心復合板、電解鋼板加抗菌涂層、人造石材板等。地面材料有環氧樹脂自流平地面、PVC防靜電地板、水磨石地面等。
2、選用符合潔凈室要求的設備
這項工作由工藝專業完成。目前的情況是：有相當比例的工藝設備不符合潔凈室的要求，表現為表面凹凸不平、易產塵積塵、污染環境。可在設備安裝后，在不影響使用的情況下，用不銹鋼板進行裝飾，使其表面平整、光潔。
3、采用壓差控制措施
根據潔凈度的高低、工藝設備的產塵情況，利用壓差有效控制污染。一般情況下，氣流應從潔凈度高的潔凈室向潔凈度低的潔凈室滲透。對于產生污染的潔凈室，除采取防止污染擴散的措施外，應使該潔凈室處于相對負壓的狀態，以防污染鄰室。
4、采用合理的人凈、物凈措施
配合建筑設計專業，合理設計人流、物流通道，根據工藝要求，采用一更、二更甚至三更的人凈方案。必要時需設置空氣吹淋室吹掉潔凈工作服上的浮塵。原材料的輸入、產品輸出，均需有很好的保護措施。如設置傳遞窗、傳遞通道。對輸入原輔料進行外包吸塵、脫外包等工序。通過壓差來控制輸入、輸出口氣流流向，應使潔凈區的靜壓比非潔凈區高15Pa。
5、采用符合潔凈度要求的氣流組織形式
這是空氣凈化的核心措施。采用過濾的方法（至少三級：粗效、中效、或亞），使送風氣流潔凈。在非單向流潔凈室中，通過合理布置送分口及回風口，靠潔凈送風氣流的擴散、稀釋作用，把污染物稀釋后從回風口排出。保持潔凈室的懸浮粒子濃度在要求的范圍內。在單向流潔凈室中，靠潔凈送風氣流“活塞”般的平推作用，把污染物從回風口壓出。